בקיץ ערכה מגמת ההדרכה סמינרים וסדנאות למשלחות בתי ספר תיכוניים לפולין, לקבוצות בני נוער, לסטודנטים מחו"ל ולמשתתפי המכבייה. במסגרת הפרויקט עם משרד התעסוקה, המסחר ותעשייה התקיים בחודש ספטמבר יום עיון בהשתתפות השר אהוד אולמרט ומנהלי בתי ספר. בד בבד נעשתה בימי העיון פעילות לבתי הספר של משרד התמ"ת.

למעלה מ-500 עובדי משרד החינוך ביקרו ביד ושם והשתתפו בימי עיון. גם קבוצות של אנשי משטרה ממחוזות שונים וקבוצות של בכירים מצה"ל השתתפו בימי עיון ביד ושם. חיילות שמדריכות את קבוצות הצבא למדו בקורס ביד ושם. עם פתיחת שנת הלימודים תשס"ו הוקם מדור חדש לכתיבת תכנית פעילות חדשה לקבוצות תלמידים מבתי ספר יסודיים.

בכינוס הארצי הראשון למורים בחודש יולי נערך טקס הענקת פרסי יד ושם למפעלים חינוכיים, ובו הוענקו פרס על תכניות לימודים, פרס לתכנית חינוך, פרס למפעל חינוכי, פרס לאיש חינוך, פרס על כתיבת ספר לילדים ולנוער, פרס על תכנית חינוך בנושא תולדות יהודי צרפת בתקופת השואה ופרסים על עבודות גמר בנושא השואה. הטקס נערך במעמד סגן שרת החינוך, התרבות והספורט דאז הרב מיכאל מלכיאור ובהשתתפות משפחות התורמים ניימן, ברגסון ויובילר, מנהלת מרכז יובילר תרצה לבציון, יושב ראש אגודת עלומים ד"ר ישראל ליכטנשטיין ודורה וינברגר.

בחודשים יולי עד ספטמבר נערכו 10 ימי עיון לצוותי מנהלים ומפקחים ממערכת החינוך ומן הרשויות המקומיות, כ-35 ימי עיון לצוותי מורים מכל רחבי הארץ וימי עיון לכ-40 מכללות להוראה מכל המגזרים – ממלכתי, ממלכתי-דתי וחרדי. עוד נערכו בבית הספר סמינרים לאנשי חינוך מחו"ל, בהם סמינר בין-לאומי (ובו השתתפו 37 איש מ-10 מדינות) וסמינר למחנכים יהודים מארבע מדינות. סמינרים אחרים נערכו למנהלי אתרי הנצחה מאוסטריה; למחנכים יהודים מהונגריה; למחנכים מקרואטיה; למחנכים יהודים ממדינות חבר העמים; למחנכים יהודים ממונטראול (בשיתוף הסוכנות היהודית); לבוגרי סמינרים של בית הספר המרכזי להוראת השואה שנערכו בפולין וליטא (32 איש מרחבי העולם); ולמחנכים מאיטליה (סמינר ראשון מסוגו ביד ושם), מגרמניה, מפולין ומרוסיה.

חזור